La epidemia surgió espontáneamente por lo cual primero se creyó que se trataba de un agente infeccioso desarrollado con fines bélicos pero aunque el origen del virus todavía no está del todo claro se puede descartar esta hipótesis. Los primeros casos fueron en 1959 en Europa y áfrica y en el año 1968 en los Estados Unidos.

Los biólogos encargados de estudiar el virus creen que podría tratarse de una afección más antigua de lo que se piensa, por la detección de la otra cepa de la enfermedad el VIH-2 ALT una variante del VIH-2 se considera la posibilidad de que el virus estuviera presente en el continente africano hace siglos.

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